Antes este pueblo estaba en lo alto de una montaña y se llamaba Miranda pero por razonas desconocidas el pueblo se bajo a pie de montaña y le cambiaron el nombre por lo que ahora se llama santa María de las hoyas.
Aunque los restos arqueológicos encontrados demuestran que estos territorios fueron ya ocupados desde la prehistoria, lo cierto es que hay pocos textos que nos documenten sobre el pasado de esta población Soriana.
Geográficamente nos encontramos con un terreno llano, de monte bajo en algunas zonas y pinar en otras.
Santa María de las Hoyas está rodeado por una naturaleza envidiable con paisajes de gran belleza. Uno de estos paisajes es el llamado “Cañón Del Río Lobos” a poca distancia cuya importancia a hecho que se considere Parque Natural.
Además podemos destacar la gran cantidad de cuevas de origen kástico tan apreciadas por los amantes de la espeleología.